この度は、お世話になります。
同じような質問が過去にあるのは確認してますが、
zabbix-agentの3.0.15では、見当たらないようなので、
念のため確認をさせてください。
＜事象＞
ログ監視(logrt)にて、監視キーワードに引っかかる度に、
ファイルの先頭から確認し、ファイルの先頭の同じメッセージを、
出力し続けております。
（アイテムのヒストリとして、常にファイルの先頭から末尾までの検知メッセージを、
キーワードに引っかかるごとに、保存するような形）
＜取った対応＞
アイテムの再作成 → 同じ事象が発生。
skipのパラメタ指定 → 同じ事象が発生。
2.2の日本語マニュアルには、下記のように記載されてます。（以下、■は抜粋）
◾ エージェントがログファイルを読み込む場合、前回の続きから読み始めます。
◾ エージェントがログファイルを前回の続きから読み始めることができるように、分析済みのバイト数（サイズカウンタ）と最終更新時間（タイムカウンタ）がZabbixデータベースに保存され、エージェントに送信されます。
◾ エージェントが認識するログサイズカウンタ値よりもログファイルが小さい場合は必ず、カウンタが0にリセットされ、エージェントは、タイムカウンタを考慮して、ログファイルの先頭から読み始めます
＜確認事項＞